脱走した少女兵器第壱機体パスティはロシア連邦保安庁と手を組み、ネオ・スカイツリーを占領した。タワー内には東京都内の住民に普及した拡張チップのサーバー機があり、パスティの《電子操作》を用いれば、装着者を死に至らしめるまで悪影響を与えることが出来る。
東京都民の大勢を人質にとった最大規模のテロ事件。
ミィルとヘレン、カズは国防庁第肆情報保全隊室長から秘密裏に潜入、パスティもしくはサーバー機の破壊を命じられる。
３Dホログラムの桜が舞い散る中、かつて仲間だったヘレンとパスティは互いの電光刀を向け合う。